Джанет Иваса прави 3-D филми за молекулите

Д-р Джанет Иваса е молекулен биолог и професионален аниматор от Медицинския университет в Харвард. Тя използва своите двойни таланти, за да създава 3-D филми за протеинови молекули.

Джанет Иваса : Анимацията на протеин може да бъде толкова сложна, колкото анимирането на човек вътре във филма на Pixar. И човек, можете да си представите, ще се нуждае от нещо, което да накара пръстите и пръстите на краката да се движат, коленете и главата, а очите мигат. Мисля, че протеините могат да бъдат толкова сложни като това.

Джанет Иваса : Протеините са в основата на работната кон на клетката, което кара клетката да се движи и да се дели.

За да анимира протеините, Iwasa работи със същия софтуер, използван за създаване на холивудски филми като Toy Story . Научните данни са ръководството на д-р Иваса. Филмите й показват протеини, които ходят и сякаш танцуват, десетки до стотици от тях наведнъж, в област, по-малка от определена точка. Тя добави, че филми като нейните могат да революционизират начина, по който учените споделят идеи помежду си.

Джанет Иваса : Начинът, по който много изследователи все още комуникират за молекулярните процеси, които изучават, е чрез наличието на тези много груби чертежи на, знаете, кръг един, протеин, взаимодейства с квадрат две, който е друг протеин, и има много стрели. Това наистина не съобщава количеството знания, което имаме днес.

EarthSky попита Иваса как точно знае, че молекулите се движат.

Джанет Иваса : Има този чудесен ресурс, наречен Банка данни за протеини, който всъщност представлява огромен брой протеинови структури, които са приносени от хиляди учени в продължение на много години. И така това е по същество своеобразна карта, така че можете да получите основно изображението на протеин x + y координатите на вашия любим протеин. И това е отправна точка за голяма част от моята анимация ...

С други думи, тя получава триизмерна картина на протеини в числова форма.

Джанет Иваса : И ние знаем, че протеините започват да се движат наоколо и те са гъвкави. Структурите в протеиновата банка не отразяват непременно това. Така че можем да добавим това с анимация. Анимацията ни позволява да синтезираме много повече информация от гледна точка на това как изглеждат протеините, как точно се движат, как точно взаимодействат с други неща. Тя обединява всичко това по този красив и ангажиращ начин.

Тя обясни любимата си анимирана молекула досега.

Джанет Иваса : Моята любима анимация е тази, която показва, че процесът на медиирана от клатрин ендоцитоза процесът, чрез който клетката е в състояние да интернализира нещо, което е извън неговата мембрана, така че да кажем, че клетката иска да интернализира това и да обработи протеина, който е току-що кацна там.

За да направите това, клетката всъщност трябва да направи балон, за да грабне протеина. И това, което тя определи като "клетка", формира, за да създаде този балон.

Джанет Иваса : Това беше доста предизвикателно, тъй като имаше 60 от тези молекули на клатрин, които също трябваше да бъдат координирани, за да образуват тази много красива клетка, а след това всичко се разпада в края. Направихме анимацията в реално време. Отне около минута и след това няколко секунди да се разпадне. Беше предизвикателно, тъй като имаше толкова много протеини, времето за него и включваше колкото се може повече други протеини.

От края на 2010 г. тя може да бъде намерена да работи с колегите си от Харвард, за да направи филм с динеин с участието на протеин, който смята да ходи вътре в клетките на нашето тяло, включително мозъчните клетки. Известен е още като "моторен" протеин, тъй като прехвърля молекули (или обекти) от една част на клетка в друга. Но учените все още не знаят как точно работи ... или как се движи. Иваса се надява да промени това.

Джанет Иваса : Просто мисля за клетката като за малък свят и че има всички тези невероятни неща, които се случват в този мъничък, мъничък мащаб, по-малък от дължината на вълната на светлината. Никога няма да можем директно да гледаме тези невероятни събития, но те се случват в телата ни всеки ден. Просто красиво нещо е да можеш да видиш. И единственият начин, по който ще можем да го направим, е чрез анимация, а може би и други средства в бъдеще.